Идеальным выглядело решение, когда исполнительный файл с тестами и тестируемая библиотека лежат в одном каталоге, как в Windows. Проблема была в том, что в Linux это не работало - экзешник не мог найти библиотеку.
Решается это просто. экзешник нужно запускать следующей командой (при условии, что текущим каталогом является тот, где лежит экзешник с библиотекой/библиотеками):
$ LD_LIBRARY_PATH=`pwd` ./executable_name
Если и это не помогает, то попробуйте посмотреть какую именно библиотеку пытается найти ваш экзешник, вызвав команду
$ ldd executable_name
или
$ readelf -d executable_name
Скорее всего просто напросто требуется библиотека с четко прописанной версией в ее названии. Например: libMyLib.so.1 вместо libMyLib.so.1.0.0
Лечится это символическими ссылками:
$ ln -s libMyLib.so.1.0.0 libMyLib.so.1
